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病菌可通过中耕、浇水、农事操作等近距离传播，病残体遇高湿的条件也可长出孢子借气流或风雨传播，从而进行侵染。棉花枯萎病菌的远距离传播，主要是借助于附着在棉花种子上的病菌和带菌的棉籽饼。

棉花枯萎病是典型积年流行病。病害的发生与消长受气候条件、耕作制度、栽培管理及土壤中线虫等因素影响。 [3] 气候条件温度和湿度是影响枯萎病发展的主要因素。通常当土壤温度达20℃左右时，田间棉苗开始发病，其后随着土温的升高，病情逐趋加重，当达25-30℃时，形成发病高峰。夏季当土温升高到33-35℃时，病害停止发展，秋季随着温度的下降，田间可岀现第二次发病高峰。

黄瓜枯萎病病原菌为白色气生菌丝，在PDA培养基上呈淡青紫色或淡褐色，小型分生孢子长椭圆形，无色，单孢或偶尔双孢，大小为（7.5-20.0）微米×（2.5-5.0）微米；大型分生孢子纺锤形，无色，多为3个隔膜，顶端细胞较长，一个隔膜（12.5-32.5）微米×（3.75-6.25）微米，2个隔膜（21.3-32.5）微米×（5.0-7.5）微米，3个隔膜（27.5-45.0）微米×（5.5-10.0）微米；厚垣孢子顶生或间生，球形，淡黄色。 [2] 病菌发育适宜的温度为24-27℃，土温24-30℃。氮肥过多以及酸性土壤利于病菌活动，在pH4.5-6的土壤中黄瓜枯萎病发生严重。

影响植株根系生长的因素往往有利于甜瓜枯萎病的发生。如天气时雨时晴，或久旱后下雨，或量过大，次数过多，田间有积水或高温、高湿、土壤偏酸性等都有利于病菌的侵入而加重发病程度。另外，地下害虫和线虫较多造成根系损伤，为病原菌的侵入提供了有利条件。抗病育种：选育优良的抗（耐）病品种，培育无病壮苗。在同一栽培条件下，早熟品种抗甜瓜枯萎病能力明显低于晚熟品种。